in un futuro prossimo a tokyo, il crimine e il terrore sono quasi scomparsi grazie all'azione di un'organizzazione governativa militare segreta chiamata da (direct attack). gli agenti di questa organizzazione sono giovani orfane, conosciute come lycoris, addestrate al combattimento armato. dopo aver violato un ordine del comando, takina inoue viene espulsa dalla da e trasferita a lavorarecon chisato nishikigi, la miglior lycoris. tuttavia, il nuovo incarico di takina si rivela molto diverso da quanto immaginato: invece di missioni ad alto rischio, lei e chisato si occupano di compiti quotidiani come consegnare caffè, animare feste per bambini e servire nella caffetteria lycoreco. mentre le due ragazze affrontano queste nuove sfide, un'organizzazione terroristica, responsabile del crollo della vecchia torre radio di tokyo dieci anni prima, trama nell'ombra contro le lycoris, minacciando la pace e la sicurezza della città.